De acordo com o site Zelda Informer, a bruxa Shia, a vilã do jogo, une três mundos de Zelda. Ou seja, o jogo vai ter os personagens e os lugares de três jogos diferentes: Twilight Princess, Skyward Sword e Ocarina of Time, isso tudo em um mesmo mundo. O que significa que o jogo não terá outros mundos, e que os personagens jogáveis vão ser apenas desses jogos específicos.
Apesar disso, o jogo terá elementos de outros jogos da franquia, como o Wind Waker que será usado por Zelda e também a Lua de Majora's Mask.
