Curiosamente, Pokémon Red, Blue, Green (apenas para o Japão) e Yellow, não terão suporte a um recurso disponibilizado em outros games do Virtual Console conhecido como "pontos de restauração". Esse recurso permite que o jogador crie um ponto de restauração e salve seu jogo em qualquer lugar que quiser, independente das próprias funções de salvamento do jogo original. Esse recurso é muito conveniente no caso do Virtual Console, pois jogos antigos eram mais restritivos nesses aspectos.
Algumas pessoas acreditam que o recurso pode não estar disponível para evitar a clonagem de Pokémon, pois quando você troca seu Pokémon, o jogo é salvo automaticamente, e com os pontos de restauração, seria possível contornar isso facilmente.
Esses são os primeiros jogos de Game Boy lançados para o Virtual Console que não utilizam os pontos de restauração.
